Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2A1P52655 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms