Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB2P49721 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms