Protein–RNA interactions for Protein: P49006

MARCKSL1, MARCKS-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSL1P49006 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCKSL1P49006 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms