Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1DP48730 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms