Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PIP4K2AP48426 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PIP4K2AP48426 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PIP4K2AP48426 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PIP4K2AP48426 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PIP4K2AP48426 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PIP4K2AP48426 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PIP4K2AP48426 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PIP4K2AP48426 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PIP4K2AP48426 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PIP4K2AP48426 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PIP4K2AP48426 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PIP4K2AP48426 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PIP4K2AP48426 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PIP4K2AP48426 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PIP4K2AP48426 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PIP4K2AP48426 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PIP4K2AP48426 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PIP4K2AP48426 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PIP4K2AP48426 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PIP4K2AP48426 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PIP4K2AP48426 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PIP4K2AP48426 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PIP4K2AP48426 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PIP4K2AP48426 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PIP4K2AP48426 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PIP4K2AP48426 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PIP4K2AP48426 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PIP4K2AP48426 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PIP4K2AP48426 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms