Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ME1P48163 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ME1P48163 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ME1P48163 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ME1P48163 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ME1P48163 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ME1P48163 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ME1P48163 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ME1P48163 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ME1P48163 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ME1P48163 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ME1P48163 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ME1P48163 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ME1P48163 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ME1P48163 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ME1P48163 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ME1P48163 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ME1P48163 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ME1P48163 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ME1P48163 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ME1P48163 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ME1P48163 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ME1P48163 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ME1P48163 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ME1P48163 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ME1P48163 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ME1P48163 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ME1P48163 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ME1P48163 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ME1P48163 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ME1P48163 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ME1P48163 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ME1P48163 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ME1P48163 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ME1P48163 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ME1P48163 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ME1P48163 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ME1P48163 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ME1P48163 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ME1P48163 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ME1P48163 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ME1P48163 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ME1P48163 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ME1P48163 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ME1P48163 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ME1P48163 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ME1P48163 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ME1P48163 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ME1P48163 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ME1P48163 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ME1P48163 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ME1P48163 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ME1P48163 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ME1P48163 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ME1P48163 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ME1P48163 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ME1P48163 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ME1P48163 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ME1P48163 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ME1P48163 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ME1P48163 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ME1P48163 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ME1P48163 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ME1P48163 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ME1P48163 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ME1P48163 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ME1P48163 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ME1P48163 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ME1P48163 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ME1P48163 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ME1P48163 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ME1P48163 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ME1P48163 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ME1P48163 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ME1P48163 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ME1P48163 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ME1P48163 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ME1P48163 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ME1P48163 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ME1P48163 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ME1P48163 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ME1P48163 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ME1P48163 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ME1P48163 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ME1P48163 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ME1P48163 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ME1P48163 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ME1P48163 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ME1P48163 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ME1P48163 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ME1P48163 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ME1P48163 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ME1P48163 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ME1P48163 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ME1P48163 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ME1P48163 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ME1P48163 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ME1P48163 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ME1P48163 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ME1P48163 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms