Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GABRB2P47870 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms