Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRATP43155 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRATP43155 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRATP43155 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRATP43155 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRATP43155 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRATP43155 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRATP43155 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRATP43155 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRATP43155 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRATP43155 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRATP43155 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRATP43155 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRATP43155 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRATP43155 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRATP43155 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRATP43155 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRATP43155 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRATP43155 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRATP43155 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRATP43155 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRATP43155 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRATP43155 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CRATP43155 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRATP43155 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRATP43155 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRATP43155 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRATP43155 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRATP43155 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRATP43155 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRATP43155 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRATP43155 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRATP43155 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRATP43155 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRATP43155 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRATP43155 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRATP43155 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRATP43155 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRATP43155 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRATP43155 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRATP43155 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRATP43155 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRATP43155 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CRATP43155 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CRATP43155 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRATP43155 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRATP43155 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRATP43155 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRATP43155 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRATP43155 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRATP43155 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRATP43155 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRATP43155 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRATP43155 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRATP43155 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRATP43155 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRATP43155 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRATP43155 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRATP43155 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CRATP43155 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRATP43155 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRATP43155 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRATP43155 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRATP43155 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRATP43155 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRATP43155 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRATP43155 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRATP43155 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRATP43155 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRATP43155 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRATP43155 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRATP43155 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRATP43155 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRATP43155 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRATP43155 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRATP43155 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRATP43155 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRATP43155 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRATP43155 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRATP43155 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRATP43155 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRATP43155 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRATP43155 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CRATP43155 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRATP43155 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRATP43155 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRATP43155 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRATP43155 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRATP43155 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRATP43155 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRATP43155 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CRATP43155 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRATP43155 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRATP43155 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRATP43155 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRATP43155 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRATP43155 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRATP43155 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRATP43155 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRATP43155 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms