Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA1P42261 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms