Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 FOB1YDR110W 1701 nt5.61□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 ERD1YDR414C 1089 nt5.61□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 VPS72YDR485C 2388 nt5.61□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 YHR127WYHR127W 732 nt5.61□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 ICE2YIL090W 1476 nt5.61□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 SSO1YPL232W 873 nt5.61□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 NOP2YNL061W 1857 nt5.6□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 PHO8YDR481C 1701 nt5.6□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 UBA1YKL210W 3075 nt5.6□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 YDR396WYDR396W 501 nt5.6□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 YPT32YGL210W 669 nt5.6□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 POM33YLL023C 840 nt5.6□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 ARB1YER036C 1833 nt5.6□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 PUS1YPL212C 1635 nt5.59□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 OXP1YKL215C 3861 nt5.59□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 GAL10YBR019C 2100 nt5.59□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 GDB1YPR184W 4611 nt5.59□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 CTR3YLR411W 726 nt5.59□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 SEC17YBL050W 879 nt5.59□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 TAH18YPR048W 1872 nt5.59□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 CST6YIL036W 1764 nt5.59□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 CCZ1YBR131W 2115 nt5.59□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 PRR1YKL116C 1557 nt5.59□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 COQ6YGR255C 1440 nt5.58□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 RBA50YDR527W 1320 nt5.58□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 MRF1YGL143C 1242 nt5.58□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 GTO1YGR154C 1071 nt5.58□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 NDC1YML031W 1968 nt5.58□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 DRS1YLL008W 2259 nt5.58□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 VPS1YKR001C 2115 nt5.57□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 FRE3YOR381W 2136 nt5.57□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 ARO10YDR380W 1908 nt5.57□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 PRP45YAL032C 1140 nt5.57□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 RER2YBR002C 861 nt5.57□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 SUE1YPR151C 621 nt5.57□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 ROG3YFR022W 2202 nt5.57□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 VID30YGL227W 2877 nt5.57□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 KDX1YKL161C 1302 nt5.56□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 AVT3YKL146W 2079 nt5.56□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 SUA5YGL169W 1281 nt5.56□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 NAG1YGR031C-A 492 nt5.56□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 ARP1YHR129C 1155 nt5.56□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 KTI12YKL110C 942 nt5.56□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 APN1YKL114C 1104 nt5.56□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 YPL062WYPL062W 405 nt5.56□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 SED4YCR067C 3198 nt5.55□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 MCH4YOL119C 1506 nt5.55□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 YDL121CYDL121C 450 nt5.55□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 SCM3YDL139C 672 nt5.55□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 YJL068CYJL068C 900 nt5.55□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 CBF1YJR060W 1056 nt5.55□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 YKR073CYKR073C 321 nt5.55□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 YTH1YPR107C 627 nt5.55□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 ADE4YMR300C 1533 nt5.54□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 YER187WYER187W 426 nt5.54□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 MAL11YGR289C 1851 nt5.54□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 YAP1YML007W 1953 nt5.53□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 YLR283WYLR283W 945 nt5.53□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 ODC2YOR222W 924 nt5.53□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 UGA1YGR019W 1416 nt5.53□□□□□ -1.52
SHQ1P40486 NOT3YIL038C 2511 nt5.52□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 NGR1YBR212W 2019 nt5.52□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.52□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 DOM34YNL001W 1161 nt5.52□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 OST3YOR085W 1053 nt5.52□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 BRE2YLR015W 1518 nt5.52□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 ENP1YBR247C 1452 nt5.51□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 PDI1YCL043C 1569 nt5.51□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 IES1YFL013C 2079 nt5.51□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 FET3YMR058W 1911 nt5.51□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 TRP1YDR007W 675 nt5.51□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 SPL2YHR136C 447 nt5.51□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 ATP14YLR295C 375 nt5.51□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 DCI1YOR180C 816 nt5.51□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 ETR1YBR026C 1143 nt5.51□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 HXT14YNL318C 1623 nt5.5□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 VAM7YGL212W 951 nt5.5□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 JJJ3YJR097W 519 nt5.5□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 BBP1YPL255W 1158 nt5.5□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 MET7YOR241W 1647 nt5.49□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 SEH1YGL100W 1050 nt5.49□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 RHO3YIL118W 696 nt5.49□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 NIT2YJL126W 924 nt5.49□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 SCW10YMR305C 1170 nt5.49□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 COX11YPL132W 903 nt5.49□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 MRI1YPR118W 1236 nt5.49□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 THP1YOL072W 1368 nt5.49□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 RSC6YCR052W 1452 nt5.49□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 THI21YPL258C 1656 nt5.49□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 MKC7YDR144C 1791 nt5.49□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 MGS1YNL218W 1764 nt5.49□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 MTC1YJL123C 1437 nt5.48□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 NSI1YDR026C 1713 nt5.48□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 APM2YHL019C 1818 nt5.48□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 FUI1YBL042C 1920 nt5.48□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 PUS5YLR165C 765 nt5.48□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 ETT1YOR051C 1239 nt5.48□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 RPL3YOR063W 1164 nt5.48□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 ZUO1YGR285C 1302 nt5.48□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 AAD4YDL243C 990 nt5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.9 ms