Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PBX2P40425 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PBX2P40425 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PBX2P40425 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PBX2P40425 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PBX2P40425 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PBX2P40425 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PBX2P40425 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PBX2P40425 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PBX2P40425 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PBX2P40425 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PBX2P40425 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PBX2P40425 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PBX2P40425 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PBX2P40425 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PBX2P40425 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PBX2P40425 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PBX2P40425 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PBX2P40425 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PBX2P40425 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PBX2P40425 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PBX2P40425 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PBX2P40425 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PBX2P40425 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PBX2P40425 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PBX2P40425 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PBX2P40425 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PBX2P40425 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PBX2P40425 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PBX2P40425 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PBX2P40425 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PBX2P40425 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PBX2P40425 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PBX2P40425 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PBX2P40425 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PBX2P40425 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PBX2P40425 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PBX2P40425 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PBX2P40425 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PBX2P40425 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PBX2P40425 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PBX2P40425 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PBX2P40425 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PBX2P40425 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PBX2P40425 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PBX2P40425 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PBX2P40425 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PBX2P40425 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PBX2P40425 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PBX2P40425 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PBX2P40425 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PBX2P40425 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PBX2P40425 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PBX2P40425 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PBX2P40425 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PBX2P40425 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PBX2P40425 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PBX2P40425 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PBX2P40425 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PBX2P40425 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PBX2P40425 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PBX2P40425 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PBX2P40425 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PBX2P40425 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PBX2P40425 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PBX2P40425 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PBX2P40425 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PBX2P40425 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PBX2P40425 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PBX2P40425 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PBX2P40425 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PBX2P40425 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PBX2P40425 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PBX2P40425 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PBX2P40425 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PBX2P40425 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PBX2P40425 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PBX2P40425 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PBX2P40425 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PBX2P40425 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PBX2P40425 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PBX2P40425 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PBX2P40425 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PBX2P40425 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PBX2P40425 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PBX2P40425 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PBX2P40425 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PBX2P40425 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PBX2P40425 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PBX2P40425 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PBX2P40425 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PBX2P40425 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PBX2P40425 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PBX2P40425 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PBX2P40425 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBX2P40425 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBX2P40425 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBX2P40425 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBX2P40425 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBX2P40425 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms