Protein–RNA interactions for Protein: P40003

VAB2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit VAB2, yeastyeast

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAB2P40003 SEC12YNR026C 1416 nt5.59□□□□□ -1.51
VAB2P40003 ESC8YOL017W 2145 nt5.59□□□□□ -1.51
VAB2P40003 CHL4YDR254W 1377 nt5.59□□□□□ -1.51
VAB2P40003 YDL027CYDL027C 1263 nt5.59□□□□□ -1.51
VAB2P40003 FAF1YIL019W 1041 nt5.59□□□□□ -1.51
VAB2P40003 YML101C-AYML101C-A 318 nt5.59□□□□□ -1.51
VAB2P40003 DCI1YOR180C 816 nt5.59□□□□□ -1.51
VAB2P40003 SCO1YBR037C 888 nt5.59□□□□□ -1.51
VAB2P40003 SRV2YNL138W 1581 nt5.59□□□□□ -1.52
VAB2P40003 ARN1YHL040C 1884 nt5.58□□□□□ -1.52
VAB2P40003 MAK32YCR019W 1092 nt5.58□□□□□ -1.52
VAB2P40003 IWR1YDL115C 1062 nt5.58□□□□□ -1.52
VAB2P40003 VAM7YGL212W 951 nt5.58□□□□□ -1.52
VAB2P40003 YLF2YHL014C 1218 nt5.58□□□□□ -1.52
VAB2P40003 MAP2YBL091C 1266 nt5.58□□□□□ -1.52
VAB2P40003 RRT2YBR246W 1164 nt5.58□□□□□ -1.52
VAB2P40003 VMA13YPR036W 1437 nt5.57□□□□□ -1.52
VAB2P40003 ERD1YDR414C 1089 nt5.57□□□□□ -1.52
VAB2P40003 SOH1YGL127C 384 nt5.57□□□□□ -1.52
VAB2P40003 FUN19YAL034C 1242 nt5.57□□□□□ -1.52
VAB2P40003 SMF3YLR034C 1422 nt5.57□□□□□ -1.52
VAB2P40003 KEL1YHR158C 3495 nt5.56□□□□□ -1.52
VAB2P40003 YDR053WYDR053W 396 nt5.56□□□□□ -1.52
VAB2P40003 TAF10YDR167W 621 nt5.56□□□□□ -1.52
VAB2P40003 MND2YIR025W 1107 nt5.56□□□□□ -1.52
VAB2P40003 RHO2YNL090W 579 nt5.56□□□□□ -1.52
VAB2P40003 RPA49YNL248C 1248 nt5.56□□□□□ -1.52
VAB2P40003 ATE1YGL017W 1512 nt5.56□□□□□ -1.52
VAB2P40003 ACS2YLR153C 2052 nt5.55□□□□□ -1.52
VAB2P40003 HAS1YMR290C 1518 nt5.55□□□□□ -1.52
VAB2P40003 ERG7YHR072W 2196 nt5.55□□□□□ -1.52
VAB2P40003 GLO2YDR272W 825 nt5.55□□□□□ -1.52
VAB2P40003 HSP31YDR533C 714 nt5.55□□□□□ -1.52
VAB2P40003 RPL21BYPL079W 483 nt5.55□□□□□ -1.52
VAB2P40003 TFB4YPR056W 1017 nt5.55□□□□□ -1.52
VAB2P40003 FLC3YGL139W 2409 nt5.55□□□□□ -1.52
VAB2P40003 RNR3YIL066C 2610 nt5.55□□□□□ -1.52
VAB2P40003 HEM3YDL205C 984 nt5.54□□□□□ -1.52
VAB2P40003 LYS5YGL154C 819 nt5.54□□□□□ -1.52
VAB2P40003 NIT2YJL126W 924 nt5.54□□□□□ -1.52
VAB2P40003 YOR1YGR281W 4434 nt5.54□□□□□ -1.52
VAB2P40003 SNU71YGR013W 1863 nt5.54□□□□□ -1.52
VAB2P40003 HAP1YLR256W 4509 nt5.53□□□□□ -1.52
VAB2P40003 YEF1YEL041W 1488 nt5.53□□□□□ -1.52
VAB2P40003 AAP1YHR047C 2571 nt5.53□□□□□ -1.52
VAB2P40003 COG1YGL223C 1254 nt5.53□□□□□ -1.52
VAB2P40003 HOR7YMR251W-A 180 nt5.53□□□□□ -1.52
VAB2P40003 CUE5YOR042W 1236 nt5.53□□□□□ -1.52
VAB2P40003 HXT3YDR345C 1704 nt5.53□□□□□ -1.52
VAB2P40003 THP1YOL072W 1368 nt5.53□□□□□ -1.52
VAB2P40003 RSC2YLR357W 2670 nt5.52□□□□□ -1.53
VAB2P40003 YMR027WYMR027W 1413 nt5.52□□□□□ -1.53
VAB2P40003 YNL057WYNL057W 333 nt5.52□□□□□ -1.53
VAB2P40003 YPR098CYPR098C 486 nt5.52□□□□□ -1.53
VAB2P40003 YAP1802YGR241C 1707 nt5.51□□□□□ -1.53
VAB2P40003 FOL1YNL256W 2475 nt5.51□□□□□ -1.53
VAB2P40003 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.51□□□□□ -1.53
VAB2P40003 ENT5YDR153C 1236 nt5.51□□□□□ -1.53
VAB2P40003 RMA1YKL132C 1293 nt5.51□□□□□ -1.53
VAB2P40003 BRF1YGR246C 1791 nt5.51□□□□□ -1.53
VAB2P40003 DOA1YKL213C 2148 nt5.51□□□□□ -1.53
VAB2P40003 HFI1YPL254W 1467 nt5.51□□□□□ -1.53
VAB2P40003 MTC5YDR128W 3447 nt5.51□□□□□ -1.53
VAB2P40003 WTM1YOR230W 1314 nt5.5□□□□□ -1.53
VAB2P40003 VBA1YMR088C 1689 nt5.5□□□□□ -1.53
VAB2P40003 NOP16YER002W 696 nt5.5□□□□□ -1.53
VAB2P40003 SCW10YMR305C 1170 nt5.5□□□□□ -1.53
VAB2P40003 YNL217WYNL217W 981 nt5.5□□□□□ -1.53
VAB2P40003 YPL199CYPL199C 723 nt5.5□□□□□ -1.53
VAB2P40003 STE50YCL032W 1041 nt5.5□□□□□ -1.53
VAB2P40003 PTK2YJR059W 2457 nt5.5□□□□□ -1.53
VAB2P40003 YDL023CYDL023C 321 nt5.49□□□□□ -1.53
VAB2P40003 SLC1YDL052C 912 nt5.49□□□□□ -1.53
VAB2P40003 YGL072CYGL072C 360 nt5.49□□□□□ -1.53
VAB2P40003 TRM10YOL093W 882 nt5.49□□□□□ -1.53
VAB2P40003 UBA3YPR066W 900 nt5.49□□□□□ -1.53
VAB2P40003 NTH2YBR001C 2343 nt5.49□□□□□ -1.53
VAB2P40003 DIT2YDR402C 1470 nt5.49□□□□□ -1.53
VAB2P40003 PRP31YGR091W 1485 nt5.49□□□□□ -1.53
VAB2P40003 EIS1YMR031C 2532 nt5.49□□□□□ -1.53
VAB2P40003 AMA1YGR225W 1782 nt5.49□□□□□ -1.53
VAB2P40003 SSK22YCR073C 3996 nt5.48□□□□□ -1.53
VAB2P40003 ZUO1YGR285C 1302 nt5.48□□□□□ -1.53
VAB2P40003 CAB1YDR531W 1104 nt5.48□□□□□ -1.53
VAB2P40003 CTR2YHR175W 570 nt5.48□□□□□ -1.53
VAB2P40003 MPM1YJL066C 759 nt5.48□□□□□ -1.53
VAB2P40003 YNL108CYNL108C 813 nt5.48□□□□□ -1.53
VAB2P40003 YPL191CYPL191C 1083 nt5.48□□□□□ -1.53
VAB2P40003 ECM3YOR092W 1842 nt5.48□□□□□ -1.53
VAB2P40003 ADE4YMR300C 1533 nt5.48□□□□□ -1.53
VAB2P40003 PDH1YPR002W 1551 nt5.47□□□□□ -1.53
VAB2P40003 BNA6YFR047C 888 nt5.47□□□□□ -1.53
VAB2P40003 SPS19YNL202W 879 nt5.47□□□□□ -1.53
VAB2P40003 SRP101YDR292C 1866 nt5.47□□□□□ -1.53
VAB2P40003 KTI12YKL110C 942 nt5.46□□□□□ -1.54
VAB2P40003 YOR024WYOR024W 324 nt5.46□□□□□ -1.54
VAB2P40003 CPA1YOR303W 1236 nt5.46□□□□□ -1.54
VAB2P40003 REI1YBR267W 1182 nt5.46□□□□□ -1.54
VAB2P40003 PDI1YCL043C 1569 nt5.46□□□□□ -1.54
VAB2P40003 RET1YOR207C 3450 nt5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26 ms