Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIK1P39086 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms