Protein–RNA interactions for Protein: P36068

SHE2, SWI5-dependent HO expression protein 2, yeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 246 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHE2	P36068	COS9	YKL219W	1224 nt		4.64	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	RPL21B	YPL079W	483 nt		4.64	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	DCC1	YCL016C	1143 nt		4.64	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	HXT14	YNL318C	1623 nt		4.64	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	UBP9	YER098W	2265 nt		4.63	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	YOL097W-A	YOL097W-A	186 nt		4.63	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	YPL062W	YPL062W	405 nt		4.63	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	NOT3	YIL038C	2511 nt		4.63	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	DAL81	YIR023W	2913 nt		4.62	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	ATG7	YHR171W	1893 nt		4.62	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	CDC19	YAL038W	1503 nt		4.62	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	TIF2	YJL138C	1188 nt		4.62	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	YJR085C	YJR085C	318 nt		4.62	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	SFK1	YKL051W	1062 nt		4.62	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	TIF1	YKR059W	1188 nt		4.62	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	CBC2	YPL178W	627 nt		4.62	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	MRPL36	YBR122C	534 nt		4.62	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	RSC6	YCR052W	1452 nt		4.62	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	BRE2	YLR015W	1518 nt		4.62	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	SPL2	YHR136C	447 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	ETT1	YOR051C	1239 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	YPL041C	YPL041C	624 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	PRR1	YKL116C	1557 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	AUA1	YFL010W-A	285 nt		4.6	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	NAG1	YGR031C-A	492 nt		4.6	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	QCR2	YPR191W	1107 nt		4.6	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	YBR230W-A	YBR230W-A	201 nt		4.6	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	ARN2	YHL047C	1863 nt		4.6	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	AVT3	YKL146W	2079 nt		4.6	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	PAN1	YIR006C	4443 nt		4.6	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	CDC4	YFL009W	2340 nt		4.59	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	PDE1	YGL248W	1110 nt		4.59	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	YGR022C	YGR022C	330 nt		4.59	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	CBP4	YGR174C	513 nt		4.59	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	YHR182W	YHR182W	2358 nt		4.59	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	RPR2	YIR015W	435 nt		4.59	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	GAL10	YBR019C	2100 nt		4.59	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	MRI1	YPR118W	1236 nt		4.59	□□□□□ -1.67
SHE2	P36068	ELP3	YPL086C	1674 nt		4.58	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	RCK1	YGL158W	1539 nt		4.58	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	RTT106	YNL206C	1368 nt		4.58	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	ZUO1	YGR285C	1302 nt		4.58	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	YKL107W	YKL107W	930 nt		4.58	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	DOM34	YNL001W	1161 nt		4.58	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	SPC97	YHR172W	2472 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	PSE1	YMR308C	3270 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	ADE6	YGR061C	4077 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	UBX7	YBR273C	1311 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	IWR1	YDL115C	1062 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	YKR073C	YKR073C	321 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	MRPL22	YNL177C	930 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	DAL82	YNL314W	768 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	MET31	YPL038W	534 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	ROT2	YBR229C	2865 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	SEC39	YLR440C	2130 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	PHO90	YJL198W	2646 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	COQ6	YGR255C	1440 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	TPS3	YMR261C	3165 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	GIR2	YDR152W	798 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	KTI12	YKL110C	942 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	SHP1	YBL058W	1272 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	SCW10	YMR305C	1170 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	YNR075C-A	YNR075C-A	93 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	ETR1	YBR026C	1143 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	snR17b	snR17b	332 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	NOC4	YPR144C	1659 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	TUL1	YKL034W	2277 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	ICE2	YIL090W	1476 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	MSH1	YHR120W	2880 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	THP1	YOL072W	1368 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	SLC1	YDL052C	912 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	NIT2	YJL126W	924 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	SOL1	YNR034W	966 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	YPL277C	YPL277C	1464 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	WTM2	YOR229W	1404 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	FUI1	YBL042C	1920 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	BLM10	YFL007W	6432 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	YER084W	YER084W	387 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	CDC28	YBR160W	897 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	ADE4	YMR300C	1533 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	NUD1	YOR373W	2556 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	EEB1	YPL095C	1371 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	LHP1	YDL051W	828 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	TRS23	YDR246W	660 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	URA3	YEL021W	804 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	YJR115W	YJR115W	510 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	PGU1	YJR153W	1086 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	YMR245W	YMR245W	621 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	RPL3	YOR063W	1164 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	YJL206C	YJL206C	2277 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SHE2	P36068	DRS1	YLL008W	2259 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	YTA6	YPL074W	2265 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	ADE3	YGR204W	2841 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	TOS3	YGL179C	1683 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	YFR035C	YFR035C	345 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	TRX2	YGR209C	315 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	KTR3	YBR205W	1215 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	PHO8	YDR481C	1701 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	STE20	YHL007C	2820 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	PEX19	YDL065C	1029 nt		4.51	□□□□□ -1.69

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