Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD13P35453 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms