Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR1P32246 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR1P32246 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR1P32246 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR1P32246 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR1P32246 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR1P32246 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR1P32246 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR1P32246 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR1P32246 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR1P32246 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR1P32246 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR1P32246 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR1P32246 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR1P32246 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR1P32246 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR1P32246 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR1P32246 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR1P32246 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR1P32246 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR1P32246 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR1P32246 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR1P32246 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR1P32246 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR1P32246 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR1P32246 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR1P32246 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR1P32246 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR1P32246 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR1P32246 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR1P32246 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR1P32246 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR1P32246 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR1P32246 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR1P32246 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR1P32246 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR1P32246 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR1P32246 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR1P32246 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR1P32246 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR1P32246 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR1P32246 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR1P32246 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR1P32246 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR1P32246 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR1P32246 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR1P32246 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR1P32246 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR1P32246 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR1P32246 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR1P32246 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR1P32246 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR1P32246 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR1P32246 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR1P32246 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR1P32246 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR1P32246 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR1P32246 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR1P32246 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR1P32246 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR1P32246 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR1P32246 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR1P32246 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR1P32246 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR1P32246 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR1P32246 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR1P32246 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR1P32246 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR1P32246 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR1P32246 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR1P32246 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR1P32246 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR1P32246 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR1P32246 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR1P32246 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR1P32246 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR1P32246 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR1P32246 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR1P32246 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR1P32246 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR1P32246 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR1P32246 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR1P32246 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR1P32246 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR1P32246 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCR1P32246 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCR1P32246 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCR1P32246 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCR1P32246 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCR1P32246 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCR1P32246 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCR1P32246 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR1P32246 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR1P32246 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR1P32246 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR1P32246 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR1P32246 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR1P32246 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR1P32246 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR1P32246 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms