Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC27P30260 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC27P30260 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC27P30260 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC27P30260 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC27P30260 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC27P30260 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC27P30260 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC27P30260 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC27P30260 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC27P30260 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC27P30260 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC27P30260 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC27P30260 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC27P30260 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC27P30260 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC27P30260 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC27P30260 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC27P30260 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC27P30260 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC27P30260 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC27P30260 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC27P30260 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC27P30260 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC27P30260 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC27P30260 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC27P30260 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC27P30260 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC27P30260 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC27P30260 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC27P30260 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC27P30260 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC27P30260 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC27P30260 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC27P30260 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC27P30260 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC27P30260 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC27P30260 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC27P30260 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC27P30260 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC27P30260 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC27P30260 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC27P30260 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC27P30260 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC27P30260 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC27P30260 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC27P30260 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC27P30260 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC27P30260 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC27P30260 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC27P30260 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC27P30260 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC27P30260 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC27P30260 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC27P30260 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC27P30260 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC27P30260 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC27P30260 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CDC27P30260 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC27P30260 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC27P30260 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC27P30260 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC27P30260 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDC27P30260 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC27P30260 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDC27P30260 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC27P30260 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC27P30260 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC27P30260 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC27P30260 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC27P30260 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC27P30260 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC27P30260 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC27P30260 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC27P30260 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC27P30260 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC27P30260 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC27P30260 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC27P30260 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC27P30260 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC27P30260 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC27P30260 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC27P30260 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC27P30260 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC27P30260 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC27P30260 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC27P30260 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC27P30260 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC27P30260 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC27P30260 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDC27P30260 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDC27P30260 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDC27P30260 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDC27P30260 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDC27P30260 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDC27P30260 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDC27P30260 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDC27P30260 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDC27P30260 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDC27P30260 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms