Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALB2P22676 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALB2P22676 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALB2P22676 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALB2P22676 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CALB2P22676 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALB2P22676 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALB2P22676 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALB2P22676 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALB2P22676 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALB2P22676 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALB2P22676 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALB2P22676 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALB2P22676 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALB2P22676 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALB2P22676 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALB2P22676 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALB2P22676 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALB2P22676 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALB2P22676 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALB2P22676 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALB2P22676 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CALB2P22676 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALB2P22676 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALB2P22676 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALB2P22676 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CALB2P22676 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALB2P22676 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALB2P22676 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALB2P22676 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALB2P22676 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CALB2P22676 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALB2P22676 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALB2P22676 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALB2P22676 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALB2P22676 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALB2P22676 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALB2P22676 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALB2P22676 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALB2P22676 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALB2P22676 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALB2P22676 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALB2P22676 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALB2P22676 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALB2P22676 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALB2P22676 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALB2P22676 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALB2P22676 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALB2P22676 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALB2P22676 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALB2P22676 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALB2P22676 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALB2P22676 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALB2P22676 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALB2P22676 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CALB2P22676 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALB2P22676 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALB2P22676 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALB2P22676 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALB2P22676 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALB2P22676 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALB2P22676 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALB2P22676 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALB2P22676 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALB2P22676 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALB2P22676 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALB2P22676 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALB2P22676 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALB2P22676 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALB2P22676 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALB2P22676 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALB2P22676 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALB2P22676 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALB2P22676 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALB2P22676 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CALB2P22676 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALB2P22676 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALB2P22676 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALB2P22676 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALB2P22676 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALB2P22676 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALB2P22676 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALB2P22676 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CALB2P22676 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALB2P22676 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALB2P22676 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CALB2P22676 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALB2P22676 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CALB2P22676 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALB2P22676 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALB2P22676 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CALB2P22676 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALB2P22676 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALB2P22676 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALB2P22676 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALB2P22676 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALB2P22676 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALB2P22676 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALB2P22676 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALB2P22676 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms