Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NF1P21359 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NF1P21359 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NF1P21359 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NF1P21359 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NF1P21359 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NF1P21359 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NF1P21359 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NF1P21359 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NF1P21359 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NF1P21359 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NF1P21359 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NF1P21359 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NF1P21359 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NF1P21359 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NF1P21359 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NF1P21359 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NF1P21359 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NF1P21359 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NF1P21359 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NF1P21359 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NF1P21359 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NF1P21359 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NF1P21359 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NF1P21359 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NF1P21359 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NF1P21359 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NF1P21359 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NF1P21359 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NF1P21359 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NF1P21359 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NF1P21359 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NF1P21359 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NF1P21359 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NF1P21359 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NF1P21359 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NF1P21359 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NF1P21359 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NF1P21359 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NF1P21359 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NF1P21359 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NF1P21359 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NF1P21359 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NF1P21359 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NF1P21359 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NF1P21359 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NF1P21359 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NF1P21359 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NF1P21359 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NF1P21359 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NF1P21359 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NF1P21359 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NF1P21359 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NF1P21359 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NF1P21359 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NF1P21359 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NF1P21359 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NF1P21359 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NF1P21359 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NF1P21359 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NF1P21359 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NF1P21359 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NF1P21359 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NF1P21359 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NF1P21359 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NF1P21359 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NF1P21359 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NF1P21359 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NF1P21359 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NF1P21359 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NF1P21359 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NF1P21359 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NF1P21359 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NF1P21359 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NF1P21359 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NF1P21359 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NF1P21359 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NF1P21359 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NF1P21359 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NF1P21359 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NF1P21359 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NF1P21359 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NF1P21359 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NF1P21359 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NF1P21359 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NF1P21359 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NF1P21359 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NF1P21359 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NF1P21359 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NF1P21359 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NF1P21359 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NF1P21359 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NF1P21359 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NF1P21359 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NF1P21359 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NF1P21359 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NF1P21359 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NF1P21359 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NF1P21359 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NF1P21359 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms