Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP4AP20648 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms