Protein–RNA interactions for Protein: P19419

ELK1, ETS domain-containing protein Elk-1, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK1P19419 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELK1P19419 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELK1P19419 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELK1P19419 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELK1P19419 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELK1P19419 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELK1P19419 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELK1P19419 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELK1P19419 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELK1P19419 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELK1P19419 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELK1P19419 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELK1P19419 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELK1P19419 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELK1P19419 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELK1P19419 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELK1P19419 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELK1P19419 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELK1P19419 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELK1P19419 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELK1P19419 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ELK1P19419 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELK1P19419 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELK1P19419 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELK1P19419 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELK1P19419 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELK1P19419 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELK1P19419 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELK1P19419 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELK1P19419 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELK1P19419 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELK1P19419 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELK1P19419 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELK1P19419 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELK1P19419 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELK1P19419 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELK1P19419 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELK1P19419 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK1P19419 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK1P19419 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK1P19419 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK1P19419 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK1P19419 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK1P19419 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK1P19419 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK1P19419 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK1P19419 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK1P19419 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK1P19419 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK1P19419 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELK1P19419 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELK1P19419 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELK1P19419 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELK1P19419 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELK1P19419 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ELK1P19419 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ELK1P19419 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ELK1P19419 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ELK1P19419 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ELK1P19419 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ELK1P19419 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ELK1P19419 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ELK1P19419 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ELK1P19419 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK1P19419 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK1P19419 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK1P19419 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK1P19419 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK1P19419 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK1P19419 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK1P19419 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK1P19419 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK1P19419 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK1P19419 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK1P19419 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK1P19419 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELK1P19419 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELK1P19419 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELK1P19419 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELK1P19419 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ELK1P19419 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELK1P19419 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELK1P19419 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELK1P19419 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELK1P19419 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELK1P19419 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELK1P19419 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELK1P19419 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELK1P19419 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELK1P19419 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELK1P19419 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELK1P19419 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELK1P19419 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELK1P19419 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELK1P19419 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELK1P19419 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELK1P19419 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELK1P19419 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELK1P19419 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELK1P19419 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms