Protein–RNA interactions for Protein: P16150

SPN, Leukosialin, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNP16150 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPNP16150 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SPNP16150 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPNP16150 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPNP16150 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPNP16150 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPNP16150 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPNP16150 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPNP16150 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPNP16150 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPNP16150 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPNP16150 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPNP16150 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPNP16150 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPNP16150 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPNP16150 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPNP16150 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPNP16150 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPNP16150 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPNP16150 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPNP16150 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPNP16150 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPNP16150 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPNP16150 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPNP16150 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPNP16150 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPNP16150 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPNP16150 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPNP16150 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPNP16150 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPNP16150 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPNP16150 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPNP16150 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPNP16150 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPNP16150 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPNP16150 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPNP16150 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPNP16150 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPNP16150 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPNP16150 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPNP16150 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPNP16150 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNP16150 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNP16150 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNP16150 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNP16150 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNP16150 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNP16150 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNP16150 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNP16150 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNP16150 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNP16150 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNP16150 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNP16150 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPNP16150 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPNP16150 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPNP16150 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPNP16150 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPNP16150 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPNP16150 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPNP16150 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPNP16150 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPNP16150 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPNP16150 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPNP16150 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPNP16150 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPNP16150 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPNP16150 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPNP16150 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPNP16150 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPNP16150 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPNP16150 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPNP16150 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPNP16150 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPNP16150 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPNP16150 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPNP16150 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPNP16150 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPNP16150 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPNP16150 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPNP16150 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPNP16150 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPNP16150 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPNP16150 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPNP16150 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPNP16150 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPNP16150 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPNP16150 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPNP16150 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPNP16150 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPNP16150 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPNP16150 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPNP16150 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPNP16150 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPNP16150 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPNP16150 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPNP16150 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPNP16150 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPNP16150 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPNP16150 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms