Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UCHL3P15374 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms