Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKIP12755 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKIP12755 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKIP12755 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKIP12755 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKIP12755 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKIP12755 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKIP12755 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKIP12755 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKIP12755 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKIP12755 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKIP12755 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKIP12755 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKIP12755 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKIP12755 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKIP12755 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKIP12755 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKIP12755 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKIP12755 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKIP12755 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKIP12755 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKIP12755 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKIP12755 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKIP12755 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKIP12755 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKIP12755 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKIP12755 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKIP12755 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKIP12755 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKIP12755 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKIP12755 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKIP12755 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKIP12755 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKIP12755 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SKIP12755 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKIP12755 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKIP12755 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKIP12755 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKIP12755 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKIP12755 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKIP12755 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKIP12755 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKIP12755 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKIP12755 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKIP12755 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKIP12755 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKIP12755 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKIP12755 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKIP12755 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKIP12755 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKIP12755 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKIP12755 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SKIP12755 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKIP12755 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKIP12755 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKIP12755 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKIP12755 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SKIP12755 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKIP12755 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKIP12755 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKIP12755 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKIP12755 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKIP12755 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKIP12755 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SKIP12755 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SKIP12755 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKIP12755 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKIP12755 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKIP12755 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKIP12755 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKIP12755 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKIP12755 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKIP12755 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKIP12755 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKIP12755 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKIP12755 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKIP12755 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKIP12755 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKIP12755 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKIP12755 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKIP12755 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKIP12755 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SKIP12755 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKIP12755 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKIP12755 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKIP12755 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKIP12755 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKIP12755 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SKIP12755 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKIP12755 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKIP12755 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKIP12755 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKIP12755 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKIP12755 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKIP12755 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKIP12755 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKIP12755 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKIP12755 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKIP12755 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKIP12755 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms