Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LAMP1P11279 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217 ms