Protein–RNA interactions for Protein: P11277

SPTB, Spectrin beta chain, erythrocytic, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBP11277 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTBP11277 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTBP11277 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTBP11277 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTBP11277 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTBP11277 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTBP11277 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTBP11277 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTBP11277 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTBP11277 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTBP11277 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBP11277 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBP11277 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBP11277 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBP11277 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBP11277 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBP11277 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBP11277 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBP11277 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTBP11277 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTBP11277 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTBP11277 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBP11277 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBP11277 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBP11277 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBP11277 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBP11277 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBP11277 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBP11277 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBP11277 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBP11277 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBP11277 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBP11277 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBP11277 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBP11277 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBP11277 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBP11277 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBP11277 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBP11277 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBP11277 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBP11277 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTBP11277 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTBP11277 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTBP11277 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTBP11277 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTBP11277 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTBP11277 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTBP11277 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTBP11277 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTBP11277 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTBP11277 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTBP11277 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTBP11277 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTBP11277 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTBP11277 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTBP11277 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTBP11277 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTBP11277 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTBP11277 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTBP11277 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTBP11277 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTBP11277 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTBP11277 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTBP11277 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTBP11277 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTBP11277 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTBP11277 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTBP11277 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTBP11277 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTBP11277 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTBP11277 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTBP11277 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTBP11277 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTBP11277 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTBP11277 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTBP11277 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTBP11277 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTBP11277 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTBP11277 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTBP11277 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPTBP11277 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPTBP11277 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPTBP11277 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTBP11277 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTBP11277 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTBP11277 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTBP11277 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTBP11277 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTBP11277 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTBP11277 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTBP11277 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTBP11277 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTBP11277 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTBP11277 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTBP11277 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTBP11277 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTBP11277 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTBP11277 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTBP11277 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTBP11277 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms