Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLUP10909 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLUP10909 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLUP10909 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLUP10909 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLUP10909 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLUP10909 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLUP10909 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLUP10909 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLUP10909 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLUP10909 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLUP10909 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLUP10909 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLUP10909 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLUP10909 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLUP10909 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLUP10909 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLUP10909 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLUP10909 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLUP10909 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLUP10909 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLUP10909 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLUP10909 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CLUP10909 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLUP10909 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLUP10909 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLUP10909 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLUP10909 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLUP10909 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLUP10909 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLUP10909 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLUP10909 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLUP10909 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLUP10909 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLUP10909 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLUP10909 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLUP10909 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLUP10909 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLUP10909 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLUP10909 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLUP10909 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLUP10909 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLUP10909 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLUP10909 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLUP10909 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLUP10909 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLUP10909 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLUP10909 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLUP10909 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLUP10909 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLUP10909 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLUP10909 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLUP10909 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLUP10909 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CLUP10909 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLUP10909 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLUP10909 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLUP10909 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLUP10909 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLUP10909 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLUP10909 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLUP10909 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLUP10909 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLUP10909 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLUP10909 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLUP10909 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CLUP10909 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLUP10909 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLUP10909 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLUP10909 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLUP10909 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLUP10909 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLUP10909 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLUP10909 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLUP10909 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLUP10909 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLUP10909 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLUP10909 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLUP10909 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLUP10909 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLUP10909 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLUP10909 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLUP10909 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLUP10909 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLUP10909 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CLUP10909 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLUP10909 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLUP10909 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLUP10909 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLUP10909 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLUP10909 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLUP10909 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLUP10909 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CLUP10909 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CLUP10909 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLUP10909 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLUP10909 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLUP10909 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLUP10909 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLUP10909 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms