Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GZMBP10144 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GZMBP10144 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GZMBP10144 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GZMBP10144 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GZMBP10144 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GZMBP10144 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GZMBP10144 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GZMBP10144 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GZMBP10144 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GZMBP10144 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GZMBP10144 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GZMBP10144 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GZMBP10144 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GZMBP10144 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GZMBP10144 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GZMBP10144 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GZMBP10144 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GZMBP10144 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GZMBP10144 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GZMBP10144 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GZMBP10144 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GZMBP10144 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GZMBP10144 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GZMBP10144 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GZMBP10144 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GZMBP10144 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GZMBP10144 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GZMBP10144 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GZMBP10144 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GZMBP10144 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GZMBP10144 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GZMBP10144 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GZMBP10144 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GZMBP10144 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GZMBP10144 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GZMBP10144 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GZMBP10144 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GZMBP10144 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GZMBP10144 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GZMBP10144 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GZMBP10144 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GZMBP10144 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GZMBP10144 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GZMBP10144 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GZMBP10144 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GZMBP10144 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GZMBP10144 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GZMBP10144 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GZMBP10144 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GZMBP10144 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GZMBP10144 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GZMBP10144 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GZMBP10144 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GZMBP10144 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GZMBP10144 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GZMBP10144 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GZMBP10144 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GZMBP10144 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GZMBP10144 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GZMBP10144 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GZMBP10144 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GZMBP10144 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GZMBP10144 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GZMBP10144 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GZMBP10144 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GZMBP10144 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GZMBP10144 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GZMBP10144 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GZMBP10144 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GZMBP10144 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GZMBP10144 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GZMBP10144 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GZMBP10144 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GZMBP10144 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GZMBP10144 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GZMBP10144 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GZMBP10144 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GZMBP10144 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GZMBP10144 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GZMBP10144 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GZMBP10144 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GZMBP10144 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GZMBP10144 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GZMBP10144 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GZMBP10144 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GZMBP10144 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GZMBP10144 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GZMBP10144 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GZMBP10144 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GZMBP10144 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GZMBP10144 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GZMBP10144 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GZMBP10144 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GZMBP10144 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GZMBP10144 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GZMBP10144 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GZMBP10144 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GZMBP10144 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GZMBP10144 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms