Protein–RNA interactions for Protein: P0DKX4

SMIM18, Small integral membrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM18P0DKX4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM18P0DKX4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMIM18P0DKX4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMIM18P0DKX4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM18P0DKX4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM18P0DKX4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM18P0DKX4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM18P0DKX4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM18P0DKX4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM18P0DKX4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM18P0DKX4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM18P0DKX4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM18P0DKX4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM18P0DKX4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM18P0DKX4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM18P0DKX4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM18P0DKX4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM18P0DKX4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM18P0DKX4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM18P0DKX4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM18P0DKX4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms