Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM228BP0C875 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAM228BP0C875 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM228BP0C875 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM228BP0C875 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM228BP0C875 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM228BP0C875 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms