Protein–RNA interactions for Protein: P09430

TNP1, Spermatid nuclear transition protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP1P09430 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TNP1P09430 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
TNP1P09430 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
TNP1P09430 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
TNP1P09430 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
TNP1P09430 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TNP1P09430 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TNP1P09430 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TNP1P09430 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
TNP1P09430 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TNP1P09430 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
TNP1P09430 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
TNP1P09430 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
TNP1P09430 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TNP1P09430 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TNP1P09430 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TNP1P09430 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TNP1P09430 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TNP1P09430 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
TNP1P09430 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TNP1P09430 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
TNP1P09430 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TNP1P09430 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TNP1P09430 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TNP1P09430 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TNP1P09430 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TNP1P09430 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TNP1P09430 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TNP1P09430 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TNP1P09430 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TNP1P09430 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TNP1P09430 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TNP1P09430 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TNP1P09430 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TNP1P09430 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TNP1P09430 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TNP1P09430 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TNP1P09430 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TNP1P09430 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TNP1P09430 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TNP1P09430 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TNP1P09430 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TNP1P09430 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TNP1P09430 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TNP1P09430 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TNP1P09430 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TNP1P09430 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TNP1P09430 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TNP1P09430 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TNP1P09430 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TNP1P09430 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TNP1P09430 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TNP1P09430 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TNP1P09430 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TNP1P09430 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TNP1P09430 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TNP1P09430 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TNP1P09430 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TNP1P09430 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TNP1P09430 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TNP1P09430 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TNP1P09430 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TNP1P09430 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TNP1P09430 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TNP1P09430 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TNP1P09430 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
TNP1P09430 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TNP1P09430 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TNP1P09430 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TNP1P09430 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TNP1P09430 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TNP1P09430 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TNP1P09430 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TNP1P09430 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TNP1P09430 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TNP1P09430 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TNP1P09430 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TNP1P09430 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TNP1P09430 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
TNP1P09430 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TNP1P09430 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TNP1P09430 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TNP1P09430 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TNP1P09430 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TNP1P09430 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TNP1P09430 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TNP1P09430 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TNP1P09430 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TNP1P09430 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TNP1P09430 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TNP1P09430 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TNP1P09430 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TNP1P09430 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TNP1P09430 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TNP1P09430 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TNP1P09430 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TNP1P09430 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TNP1P09430 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TNP1P09430 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TNP1P09430 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms