Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPRAP08240 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms