Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LDHBP07195 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LDHBP07195 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LDHBP07195 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LDHBP07195 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LDHBP07195 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LDHBP07195 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LDHBP07195 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LDHBP07195 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LDHBP07195 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LDHBP07195 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LDHBP07195 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LDHBP07195 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LDHBP07195 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LDHBP07195 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LDHBP07195 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LDHBP07195 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LDHBP07195 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
LDHBP07195 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LDHBP07195 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LDHBP07195 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LDHBP07195 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LDHBP07195 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LDHBP07195 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LDHBP07195 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LDHBP07195 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LDHBP07195 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LDHBP07195 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LDHBP07195 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LDHBP07195 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LDHBP07195 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LDHBP07195 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LDHBP07195 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LDHBP07195 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LDHBP07195 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LDHBP07195 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LDHBP07195 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LDHBP07195 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LDHBP07195 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LDHBP07195 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LDHBP07195 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LDHBP07195 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LDHBP07195 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LDHBP07195 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LDHBP07195 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LDHBP07195 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LDHBP07195 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LDHBP07195 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LDHBP07195 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LDHBP07195 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LDHBP07195 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LDHBP07195 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LDHBP07195 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LDHBP07195 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LDHBP07195 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LDHBP07195 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LDHBP07195 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LDHBP07195 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LDHBP07195 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LDHBP07195 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LDHBP07195 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LDHBP07195 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LDHBP07195 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LDHBP07195 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LDHBP07195 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LDHBP07195 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LDHBP07195 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LDHBP07195 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LDHBP07195 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LDHBP07195 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LDHBP07195 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LDHBP07195 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LDHBP07195 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LDHBP07195 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LDHBP07195 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LDHBP07195 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LDHBP07195 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LDHBP07195 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LDHBP07195 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LDHBP07195 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LDHBP07195 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LDHBP07195 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LDHBP07195 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LDHBP07195 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LDHBP07195 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LDHBP07195 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LDHBP07195 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LDHBP07195 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LDHBP07195 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LDHBP07195 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LDHBP07195 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LDHBP07195 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LDHBP07195 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LDHBP07195 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LDHBP07195 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LDHBP07195 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LDHBP07195 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LDHBP07195 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LDHBP07195 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LDHBP07195 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms