Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFAP2AP05549 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFAP2AP05549 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFAP2AP05549 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TFAP2AP05549 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFAP2AP05549 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TFAP2AP05549 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFAP2AP05549 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TFAP2AP05549 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TFAP2AP05549 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TFAP2AP05549 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFAP2AP05549 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFAP2AP05549 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFAP2AP05549 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TFAP2AP05549 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFAP2AP05549 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFAP2AP05549 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFAP2AP05549 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFAP2AP05549 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TFAP2AP05549 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFAP2AP05549 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TFAP2AP05549 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TFAP2AP05549 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFAP2AP05549 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFAP2AP05549 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TFAP2AP05549 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFAP2AP05549 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TFAP2AP05549 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TFAP2AP05549 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFAP2AP05549 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TFAP2AP05549 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFAP2AP05549 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFAP2AP05549 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFAP2AP05549 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TFAP2AP05549 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TFAP2AP05549 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFAP2AP05549 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TFAP2AP05549 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFAP2AP05549 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFAP2AP05549 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFAP2AP05549 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFAP2AP05549 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFAP2AP05549 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFAP2AP05549 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TFAP2AP05549 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFAP2AP05549 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAP2AP05549 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms