Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC2P02655 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
APOC2P02655 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
APOC2P02655 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOC2P02655 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOC2P02655 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOC2P02655 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOC2P02655 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOC2P02655 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOC2P02655 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOC2P02655 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOC2P02655 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOC2P02655 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOC2P02655 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOC2P02655 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOC2P02655 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
APOC2P02655 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOC2P02655 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOC2P02655 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOC2P02655 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOC2P02655 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOC2P02655 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOC2P02655 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOC2P02655 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOC2P02655 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOC2P02655 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOC2P02655 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOC2P02655 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOC2P02655 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOC2P02655 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOC2P02655 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOC2P02655 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOC2P02655 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOC2P02655 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOC2P02655 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOC2P02655 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOC2P02655 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOC2P02655 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOC2P02655 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOC2P02655 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOC2P02655 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOC2P02655 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOC2P02655 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOC2P02655 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOC2P02655 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOC2P02655 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOC2P02655 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOC2P02655 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOC2P02655 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOC2P02655 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOC2P02655 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOC2P02655 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOC2P02655 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOC2P02655 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOC2P02655 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOC2P02655 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOC2P02655 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOC2P02655 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOC2P02655 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOC2P02655 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOC2P02655 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOC2P02655 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOC2P02655 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOC2P02655 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
APOC2P02655 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOC2P02655 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOC2P02655 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOC2P02655 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOC2P02655 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOC2P02655 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOC2P02655 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOC2P02655 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOC2P02655 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOC2P02655 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOC2P02655 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOC2P02655 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOC2P02655 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOC2P02655 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOC2P02655 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOC2P02655 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOC2P02655 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOC2P02655 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOC2P02655 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOC2P02655 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOC2P02655 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOC2P02655 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOC2P02655 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOC2P02655 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APOC2P02655 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APOC2P02655 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOC2P02655 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOC2P02655 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOC2P02655 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOC2P02655 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOC2P02655 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOC2P02655 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOC2P02655 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOC2P02655 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
APOC2P02655 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOC2P02655 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.3 ms