Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL2A1P02458 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
COL2A1P02458 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL2A1P02458 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COL2A1P02458 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.56■■■□□ 2
COL2A1P02458 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
COL2A1P02458 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL2A1P02458 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
COL2A1P02458 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL2A1P02458 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL2A1P02458 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
COL2A1P02458 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
COL2A1P02458 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL2A1P02458 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL2A1P02458 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL2A1P02458 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
COL2A1P02458 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL2A1P02458 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
COL2A1P02458 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL2A1P02458 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
COL2A1P02458 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
COL2A1P02458 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL2A1P02458 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
COL2A1P02458 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
COL2A1P02458 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
COL2A1P02458 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.52■■■□□ 2
COL2A1P02458 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL2A1P02458 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.52■■■□□ 2
COL2A1P02458 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL2A1P02458 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
COL2A1P02458 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL2A1P02458 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL2A1P02458 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
COL2A1P02458 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
COL2A1P02458 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
COL2A1P02458 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms