Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TIMP1P01033 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms