Protein–RNA interactions for Protein: P00739

HPR, Haptoglobin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPRP00739 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPRP00739 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPRP00739 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPRP00739 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPRP00739 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPRP00739 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPRP00739 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPRP00739 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPRP00739 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPRP00739 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPRP00739 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPRP00739 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPRP00739 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPRP00739 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPRP00739 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPRP00739 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPRP00739 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPRP00739 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPRP00739 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPRP00739 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPRP00739 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HPRP00739 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPRP00739 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPRP00739 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HPRP00739 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPRP00739 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPRP00739 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPRP00739 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPRP00739 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPRP00739 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPRP00739 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPRP00739 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPRP00739 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPRP00739 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPRP00739 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPRP00739 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPRP00739 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPRP00739 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPRP00739 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPRP00739 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPRP00739 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPRP00739 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPRP00739 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPRP00739 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPRP00739 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPRP00739 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPRP00739 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPRP00739 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPRP00739 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPRP00739 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPRP00739 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPRP00739 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPRP00739 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPRP00739 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPRP00739 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPRP00739 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPRP00739 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPRP00739 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPRP00739 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPRP00739 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPRP00739 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPRP00739 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPRP00739 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPRP00739 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPRP00739 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPRP00739 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPRP00739 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPRP00739 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPRP00739 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPRP00739 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPRP00739 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPRP00739 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPRP00739 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPRP00739 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPRP00739 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPRP00739 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HPRP00739 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HPRP00739 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPRP00739 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPRP00739 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPRP00739 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPRP00739 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPRP00739 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPRP00739 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPRP00739 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPRP00739 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPRP00739 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HPRP00739 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPRP00739 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPRP00739 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPRP00739 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPRP00739 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPRP00739 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPRP00739 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPRP00739 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPRP00739 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPRP00739 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPRP00739 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPRP00739 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPRP00739 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms