Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POP4O95707 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POP4O95707 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POP4O95707 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POP4O95707 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POP4O95707 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POP4O95707 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POP4O95707 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POP4O95707 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
POP4O95707 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POP4O95707 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POP4O95707 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POP4O95707 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POP4O95707 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POP4O95707 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POP4O95707 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POP4O95707 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POP4O95707 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POP4O95707 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POP4O95707 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POP4O95707 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POP4O95707 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POP4O95707 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POP4O95707 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POP4O95707 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POP4O95707 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POP4O95707 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POP4O95707 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POP4O95707 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POP4O95707 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POP4O95707 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POP4O95707 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POP4O95707 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POP4O95707 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POP4O95707 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POP4O95707 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POP4O95707 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POP4O95707 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POP4O95707 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POP4O95707 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POP4O95707 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POP4O95707 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POP4O95707 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POP4O95707 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POP4O95707 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POP4O95707 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POP4O95707 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POP4O95707 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POP4O95707 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POP4O95707 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POP4O95707 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POP4O95707 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POP4O95707 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POP4O95707 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POP4O95707 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POP4O95707 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POP4O95707 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POP4O95707 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POP4O95707 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POP4O95707 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POP4O95707 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POP4O95707 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
POP4O95707 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POP4O95707 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POP4O95707 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POP4O95707 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POP4O95707 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POP4O95707 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
POP4O95707 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POP4O95707 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
POP4O95707 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POP4O95707 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POP4O95707 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POP4O95707 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POP4O95707 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POP4O95707 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POP4O95707 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POP4O95707 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POP4O95707 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POP4O95707 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POP4O95707 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POP4O95707 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POP4O95707 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POP4O95707 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POP4O95707 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP4O95707 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP4O95707 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP4O95707 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP4O95707 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP4O95707 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP4O95707 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP4O95707 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP4O95707 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP4O95707 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP4O95707 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP4O95707 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP4O95707 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POP4O95707 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POP4O95707 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POP4O95707 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms