Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE4BO95155 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE4BO95155 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE4BO95155 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE4BO95155 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE4BO95155 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE4BO95155 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE4BO95155 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE4BO95155 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE4BO95155 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms