Protein–RNA interactions for Protein: O94941

UBOX5, RING finger protein 37, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBOX5O94941 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBOX5O94941 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBOX5O94941 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBOX5O94941 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBOX5O94941 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBOX5O94941 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBOX5O94941 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBOX5O94941 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBOX5O94941 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBOX5O94941 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBOX5O94941 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBOX5O94941 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBOX5O94941 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBOX5O94941 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBOX5O94941 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBOX5O94941 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBOX5O94941 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBOX5O94941 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBOX5O94941 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBOX5O94941 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBOX5O94941 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBOX5O94941 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBOX5O94941 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBOX5O94941 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBOX5O94941 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBOX5O94941 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBOX5O94941 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBOX5O94941 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBOX5O94941 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBOX5O94941 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBOX5O94941 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBOX5O94941 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBOX5O94941 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBOX5O94941 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBOX5O94941 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBOX5O94941 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBOX5O94941 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBOX5O94941 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBOX5O94941 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms