Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC4O75487 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC4O75487 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC4O75487 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC4O75487 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC4O75487 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC4O75487 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC4O75487 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC4O75487 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC4O75487 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC4O75487 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC4O75487 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC4O75487 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC4O75487 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC4O75487 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC4O75487 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC4O75487 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC4O75487 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC4O75487 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC4O75487 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC4O75487 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC4O75487 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC4O75487 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC4O75487 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC4O75487 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC4O75487 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC4O75487 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC4O75487 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC4O75487 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC4O75487 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC4O75487 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC4O75487 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC4O75487 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC4O75487 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC4O75487 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC4O75487 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC4O75487 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC4O75487 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC4O75487 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC4O75487 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC4O75487 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC4O75487 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC4O75487 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPC4O75487 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPC4O75487 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC4O75487 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC4O75487 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC4O75487 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC4O75487 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC4O75487 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC4O75487 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC4O75487 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC4O75487 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC4O75487 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC4O75487 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC4O75487 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC4O75487 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC4O75487 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC4O75487 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC4O75487 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC4O75487 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC4O75487 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC4O75487 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC4O75487 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC4O75487 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC4O75487 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC4O75487 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC4O75487 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC4O75487 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC4O75487 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC4O75487 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC4O75487 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC4O75487 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC4O75487 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC4O75487 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC4O75487 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC4O75487 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC4O75487 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC4O75487 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC4O75487 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC4O75487 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC4O75487 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC4O75487 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC4O75487 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC4O75487 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC4O75487 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC4O75487 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC4O75487 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC4O75487 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC4O75487 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC4O75487 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC4O75487 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC4O75487 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC4O75487 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC4O75487 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC4O75487 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC4O75487 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC4O75487 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC4O75487 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC4O75487 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms