Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GADD45BO75293 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GADD45BO75293 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms