Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms