Protein–RNA interactions for Protein: O75030

MITF, Microphthalmia-associated transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITFO75030 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MITFO75030 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MITFO75030 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MITFO75030 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MITFO75030 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MITFO75030 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MITFO75030 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MITFO75030 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MITFO75030 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MITFO75030 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MITFO75030 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MITFO75030 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MITFO75030 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MITFO75030 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MITFO75030 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MITFO75030 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MITFO75030 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MITFO75030 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MITFO75030 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MITFO75030 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MITFO75030 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MITFO75030 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MITFO75030 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MITFO75030 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MITFO75030 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MITFO75030 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MITFO75030 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MITFO75030 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
MITFO75030 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MITFO75030 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MITFO75030 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MITFO75030 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MITFO75030 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MITFO75030 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MITFO75030 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MITFO75030 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MITFO75030 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MITFO75030 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MITFO75030 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MITFO75030 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MITFO75030 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MITFO75030 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MITFO75030 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MITFO75030 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MITFO75030 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MITFO75030 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MITFO75030 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MITFO75030 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MITFO75030 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MITFO75030 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MITFO75030 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MITFO75030 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MITFO75030 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MITFO75030 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MITFO75030 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MITFO75030 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MITFO75030 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MITFO75030 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MITFO75030 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MITFO75030 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MITFO75030 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MITFO75030 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MITFO75030 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MITFO75030 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MITFO75030 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MITFO75030 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MITFO75030 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MITFO75030 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MITFO75030 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MITFO75030 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MITFO75030 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MITFO75030 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MITFO75030 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MITFO75030 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MITFO75030 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MITFO75030 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MITFO75030 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MITFO75030 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MITFO75030 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MITFO75030 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MITFO75030 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MITFO75030 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MITFO75030 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MITFO75030 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MITFO75030 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MITFO75030 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MITFO75030 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MITFO75030 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MITFO75030 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MITFO75030 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MITFO75030 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MITFO75030 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MITFO75030 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MITFO75030 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MITFO75030 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MITFO75030 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MITFO75030 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MITFO75030 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MITFO75030 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MITFO75030 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.4 ms