Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMM17BO60830 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMM17BO60830 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMM17BO60830 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMM17BO60830 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMM17BO60830 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMM17BO60830 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMM17BO60830 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMM17BO60830 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMM17BO60830 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMM17BO60830 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMM17BO60830 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMM17BO60830 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMM17BO60830 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMM17BO60830 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMM17BO60830 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMM17BO60830 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMM17BO60830 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMM17BO60830 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMM17BO60830 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM17BO60830 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM17BO60830 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM17BO60830 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM17BO60830 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM17BO60830 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM17BO60830 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms