Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP5O60239 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms