Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VEGFDO43915 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms