Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIAH2O43255 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIAH2O43255 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIAH2O43255 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIAH2O43255 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIAH2O43255 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIAH2O43255 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIAH2O43255 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIAH2O43255 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIAH2O43255 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIAH2O43255 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIAH2O43255 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIAH2O43255 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIAH2O43255 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIAH2O43255 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIAH2O43255 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIAH2O43255 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIAH2O43255 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIAH2O43255 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIAH2O43255 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIAH2O43255 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIAH2O43255 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIAH2O43255 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIAH2O43255 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIAH2O43255 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIAH2O43255 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIAH2O43255 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIAH2O43255 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIAH2O43255 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIAH2O43255 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms