Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms